El virus de la encefalomielitis equina del Este pertenece al género Alphavirus de la familia Togaviridae. El virus de la encefalomielitis equina del Este está presente en el continente americano y puede causar enfermedad tanto en humanos como en équidos, con encefalitis en la mayoría de los casos clínicos. El virus se mantiene normalmente en la naturaleza alternando entre huéspedes vertebrados y mosquitos vectores. La encefalitis causada por este virus se produce esporádicamente en caballos y humanos desde mediados del verano hasta finales del otoño en las regiones templadas, pero puede producirse durante todo el año en las regiones tropicales, dependiendo de las condiciones climáticas que favorecen la presencia del mosquito vector. La enfermedad clínica en los caballos se caracteriza por fiebre, anorexia y depresión. En los casos más graves, puede evolucionar a hiperexcitabilidad, ceguera, ataxia, depresión mental grave, postración, convulsiones y muerte. La infección por el virus de la encefalomielitis equina del Este en los caballos suele ser mortal. Los principales reservorios del virus son las aves paseriformes. La mayoría de las infecciones en aves no son clínicas, pero se ha notificado que el virus causa enfermedades en aves de corral, aves de caza y ratites. Los pequeños mamíferos, como los roedores, también pueden amplificar la encefalomielitis equina del Este. Se han notificado casos esporádicos en vacas, ovejas, cerdos, ciervos y perros. Los caballos y los seres humanos son huéspedes terminales fortuitos de la enfermedad. Sin embargo, algunos caballos pueden desarrollar una viremia transitoria que se ha sugerido que es suficiente para transmitir el virus a los mosquitos en las condiciones adecuadas. Las vacunas contra la encefalomielitis equina del Este son seguras e inmunogénicas.
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